El 18 de diciembre de 2009, Juan José Zapag asumía la presidencia de Cerro Porteño, tras el fin del mandato de Luis Alberto Pettengill.
Juan José Zapag reveló que aspira a cumplir el sueño del Polideportivo para luego dejar Cerro Porteño.
Juan José Zapag celebró con los jugadores de Cerro Porteño la conquista de la Liga Premium 2024 de Futsal FIFA. A días de la revancha ante Athletico Parananense por la Copa Sudamericana 2024, el presidente del Ciclón lanzó un mensaje para los futbolistas de Manolo Jiménez.
El relator principal de ABC AM 730, Bruno Pont, se lanzó verbalmente con todo contra el presidente del club Cerro Porteño, Juan José Zapag. Criticó que no haga arengas a su equipo en los momentos que el plantel necesita, más en estas últimas fechas en que el Ciclón buscaba acercarse al título de campeón del Apertura.
Juan José Zapag criticó a los socios opositores, que fueron a la Asamblea Ordinaria de Cerro Porteño a insultar y pedir la renuncia del presidente.
Juan José Zapag habló después de la tensa Asamblea Ordinaria de Cerro Porteño en La Nueva Olla. Entre insultos y abucheos, los socios aprobaron el balance del ejercicio 2023. El presidente del Ciclón lanzó un duro mensaje para los opositores.